Não. A integração via Web Service é oferecida gratuitamente pela prefeitura.
O custo chamado "Integra Fácil" que aparece no painel de algumas prefeituras (como as que usam o ISS Net Online) refere-se a um serviço de suporte/consultoria para a integração ao Web Service — contratado diretamente com a prefeitura ou com terceiros. Usando a Nota RP, você já tem acesso a um sistema integrado e em pleno funcionamento, sem precisar contratar esse tipo de suporte.